tbjournalТуберкулез и социально значимые заболеванияTuberculosis and socially significant diseases2413-03462413-0354ООО «Ин-Тренд10.54921/2413-0346-2024-12-1-4-8tbjournal-130Research ArticleЛЕКАРСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗАDRUG RESISTANCE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSISИзучение мутаций в генах mmpR и atpE, ассоциированных с развитием устойчивости Mycobacterium tuberculosis к бедаквилинуStudy of mutations in the mmpR and atpE genes associated with the development of Mycobacterium tuberculosis resistance to bedaquilineПеретокинаИ. В.PeretokinaI. V.

Перетокина Ирина Витальевна – врач-бактериолог Централизованной бактериологической лаборатории

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10, стр. 1

Тел. + 7 (499) 268-70-33

Moscow

iraperetokina@yandex.ruКрыловаЛ. Ю.KrylovaL. Yu.

Крылова Людмила Юрьевна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, кандидат биологических наук

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10, стр. 1

Тел. + 7 (499) 268-70-33

Moscow

luda.yurievna2017@yandex.ruФрейманГ. Е.FreimanG. E.

Фрейман Георгий Ефимович – заведующий Централизованной бактериологической лабораторией, кандидат медицинских наук

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10, стр. 1

Тел. + 7 (499) 268-70-33

Moscow

g.freiman@mail.ruНосоваЕ. Ю.NosovaE. Yu.

Носова Елена Юрьевна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, доктор медицинских наук

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10, стр. 1

Тел. + 7 (495) 603-30-33

Moscow

rna68@rambler.ruЗименковД. В.ZimenkovD. V.

Зименков Данила Вадимович – ведущий научный сотрудник лаборатории технологий молекулярной диагностики Центра высокоточного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины, кандидат биологических наук

119334, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32, стр. 1

Тел. + 7 (499) 135-14-05

z@biochip.ruГБУЗ «Московский научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»РоссияFederal State Budgetary Scientific Institution «Central Scientific Research Institute of Tuberculosis»Russian FederationФГБУН «Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук»РоссияEngelhardt Institute of Molecular Biology (EIMB)Russian Federation20243003202412148Copyright © Перетокина И.В., Крылова Л.Ю., Фрейман Г.Е., Носова Е.Ю., Зименков Д.В., 20242024Перетокина И.В., Крылова Л.Ю., Фрейман Г.Е., Носова Е.Ю., Зименков Д.В.Peretokina I.V., Krylova L.Y., Freiman G.E., Nosova E.Y., Zimenkov D.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tb-journal.ru/jour/article/view/130

В ходе проведенного исследования получены и проанализированы результаты изучения развития устойчивости Mycobacterium tuberculosis к новому противотуберкулезному препарату бедаквилину. Путем полногеномного секвенирования 16 штаммов, выделенных от 16 больных туберкулезом легких после окончания лечения данным препаратом, выявлены 20 мутаций в гене mmpR и 6 мутаций в гене-мишени atpE, ассоциированные с устойчивостью к бедаквилину in vitro. Установлено, что значения МИК препарата при обнаружении мутаций в гене atpE штаммов значительно выше, чем при выявлении мутаций в гене mmpR.

In the study we obtained and analyzed the results of the development of resistance of Mycobacterium tuberculosis to the novel antitubercular drug bedaquiline. We investigate 16 strains isolated from 16 patients with pulmonary TB after bedaquiline therapy. With the help of wholegenome sequencing we detected 20 mutations in the mmpR gene and 6 mutations in the target gene atpE associated with bedaquiline resistance in vitro. It was found, that MIC values of bedaquiline were significantly higher for strains with mutations in the atpE gene than for MTB strains with mutations in the mmpR gene.

Mycobacterium tuberculosisбедаквилинлекарственная устойчивостьмутацииMycobacterium tuberculosisbedaquilinedrug resistancemutationsReferencesВасильева И.А., Тестов В.В., Стерликов С.А. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в годы пандемии COVID-19 – 2020–2021 гг. // Туберкулез и болезни легких. – 2022. – Т. 100. – № 3. – С. 6-12.Васильева И.А., Тестов В.В., Стерликов С.А. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в годы пандемии COVID-19 – 2020–2021 гг. // Туберкулез и болезни легких. – 2022. – Т. 100. – № 3. – С. 6-12.Туберкулез у взрослых: клинические рекомендации. 2022–2023–2024 / Утв. Минздравом России от 04.03.2022. – [Электронный ресурс] http://disuria.ru/_ld/11/1173_kr22A15A19MZ.pdf.Туберкулез у взрослых: клинические рекомендации. 2022–2023–2024 / Утв. Минздравом России от 04.03.2022. – [Электронный ресурс] http://disuria.ru/_ld/11/1173_kr22A15A19MZ.pdf.Литвинов В.И., Макарова М.В., Носова Е.Ю., Сафонова С.Г. Изучение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза // Туберкулез и социально значимые заболевания. – 2016. – №4. – С. 45-55.Литвинов В.И., Макарова М.В., Носова Е.Ю., Сафонова С.Г. Изучение лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза // Туберкулез и социально значимые заболевания. – 2016. – №4. – С. 45-55.Andries K., Villellas C., Coeck N., Thys K., Gevers T., Vranckx L., Lounis N., de Jong B.C., Koul A. Acquired resistance of Mycobacterium tuberculosis to bedaquiline // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 7. – P. e102135.Andries K., Villellas C., Coeck N., Thys K., Gevers T., Vranckx L., Lounis N., de Jong B.C., Koul A. Acquired resistance of Mycobacterium tuberculosis to bedaquiline // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 7. – P. e102135.Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Susceptibility testing of mycobacteria, nocardiae, and other aerobic actinomycetes / CLSI document M24-A2. Аpproved standard. – 2nd ed. - Wayne, PA, 2011. – 61 р.Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Susceptibility testing of mycobacteria, nocardiae, and other aerobic actinomycetes / CLSI document M24-A2. Аpproved standard. – 2nd ed. - Wayne, PA, 2011. – 61 р.Nieto Ramirez L.M., Quintero Vargas K., Diaz G. Whole genome sequencing for the analysis of drug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis: a systematic review for bedaquiline and delamanid // Antibiotics (Basel). – 2020. – Vol. 9, № 3. – P. 133.Nieto Ramirez L.M., Quintero Vargas K., Diaz G. Whole genome sequencing for the analysis of drug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis: a systematic review for bedaquiline and delamanid // Antibiotics (Basel). – 2020. – Vol. 9, № 3. – P. 133.Rodrigues C., Jani J., Shenai S., Thakkar P., Siddiqi S., Mehta A. Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis against second-lane drugs using the Bactec MGIT 960 system // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2008. – Vol. 12, № 12. – P. 1449-1455.Rodrigues C., Jani J., Shenai S., Thakkar P., Siddiqi S., Mehta A. Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis against second-lane drugs using the Bactec MGIT 960 system // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2008. – Vol. 12, № 12. – P. 1449-1455.Rüsch-Gerdes S., Pfyffer G.E., Casal M., Chadwick M., Siddiqi S. Multicenter laboratory validation of the BACTEC MGIT 960 technique for testing susceptibilities of Mycobacterium tuberculosis to classical second-line drugs and newer antimicrobials // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, № 3. – P. 688-692.Rüsch-Gerdes S., Pfyffer G.E., Casal M., Chadwick M., Siddiqi S. Multicenter laboratory validation of the BACTEC MGIT 960 technique for testing susceptibilities of Mycobacterium tuberculosis to classical second-line drugs and newer antimicrobials // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, № 3. – P. 688-692.Siddiqi S.H., Rusch-Gerdes S. MGIT procedure manual for BACTEC™ MGIT 960™ system. – Foundation for Innovative New Diagnostics, 2006. – 74 p. [Электронный ресурс] https://www.finddx.org/wp-content/uploads/2016/02/mgit_manual_nov2006.pdf.Siddiqi S.H., Rusch-Gerdes S. MGIT procedure manual for BACTEC™ MGIT 960™ system. – Foundation for Innovative New Diagnostics, 2006. – 74 p. [Электронный ресурс] https://www.finddx.org/wp-content/uploads/2016/02/mgit_manual_nov2006.pdf.Torrea G., Coeck N., Desmaretz C., Parre T.V.D., Poucke T.V., Lounis N., de Jong B.C., Rigouts L. Bedaquiline susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis in an automated liquid culture system // J. Antimicrob. Chemother. – 2015. – Vol. 70, № 8. – P. 2300-2305.Torrea G., Coeck N., Desmaretz C., Parre T.V.D., Poucke T.V., Lounis N., de Jong B.C., Rigouts L. Bedaquiline susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis in an automated liquid culture system // J. Antimicrob. Chemother. – 2015. – Vol. 70, № 8. – P. 2300-2305.Zimenkov D.V., Nosova E.Y., Kulagina E.V., Antonova O.V., Arslanbaeva L.R., Isakova A.I., Krylova L.Y., Peretokina I.V., Makarova M.V., Safonova S.G., Borisov S.E., Gryadunov D.A. Examination of bedaquiline – and linezolid-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from the Moscow region // J. Antimicrobial. Chemotherapy. – 2017. – Vol. 72, № 7. – P. 1901-1906.Zimenkov D.V., Nosova E.Y., Kulagina E.V., Antonova O.V., Arslanbaeva L.R., Isakova A.I., Krylova L.Y., Peretokina I.V., Makarova M.V., Safonova S.G., Borisov S.E., Gryadunov D.A. Examination of bedaquiline – and linezolid-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from the Moscow region // J. Antimicrobial. Chemotherapy. – 2017. – Vol. 72, № 7. – P. 1901-1906.World Health Organization. WHO consolidated guidelines on tuberculosis: module 4: treatment: drug-resistant tuberculosis treatment. – Geneva: WHO, 2020. [Электронный ресурс] https://www.who.int/publications-detail-redirect/9789240007048.World Health Organization. WHO consolidated guidelines on tuberculosis: module 4: treatment: drug-resistant tuberculosis treatment. – Geneva: WHO, 2020. [Электронный ресурс] https://www.who.int/publications-detail-redirect/9789240007048.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.