tbjournalТуберкулез и социально значимые заболеванияTuberculosis and socially significant diseases2413-03462413-0354ООО «Ин-Тренд10.54921/2413-0346-2021-12-3-37-44tbjournal-70Research ArticleДИАГНОСТИКА И КЛИНИКА ТУБЕРКУЛЕЗАDIAGNOSIS AND CLINIC OF TUBERCULOSISНовые подходы к диагностике туберкулеза и определению лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза к антибактериальным препаратамNew approaches to the diagnosis of tuberculosis and the determination of the drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis to antimicrobial drugsНосоваЕ. Ю.NosovaE. Yu.

Носова Елена Юрьевна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, кандидат медицинских наук 

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

Rna68@rambler.ruМакароваМ. В.MakarovaM. V.

Макарова Марина Витальевна – главный научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, доктор биологических наук 

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

makarova75@yandex.ruМихайловаЮ. Д.MikhailovaYu. D.

Михайлова Юлия Дмитриевна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, кандидат биологических наук 

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

Juliaisaeva81@rambler.ruСвириденкоМ. А.SviridenkoM. A.

Свириденко Мария Александровна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, кандидат медицинских наук 

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

Dna77@mail.ruХахалинаА. А.KhakhalinaA. A.

Хахалина Анастасия Александровна – ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, кандидат биологических наук

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

nastec@bk.ruСафоноваС. Г.SafonovaS. G.

Сафонова Светлана Григорьевна – заведующая отделом проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии, доктор биологических наук 

107014, г. Москва, ул. Стромынка, д. 10

safonova.s.g@inbox.ruГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»Russian Federation202130092021933744Copyright © Носова Е.Ю., Макарова М.В., Михайлова Ю.Д., Свириденко М.А., Хахалина А.А., Сафонова С.Г., 20212021Носова Е.Ю., Макарова М.В., Михайлова Ю.Д., Свириденко М.А., Хахалина А.А., Сафонова С.Г.Nosova E.Y., Makarova M.V., Mikhailova Y.D., Sviridenko M.A., Khakhalina A.A., Safonova S.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tb-journal.ru/jour/article/view/70

Проведено исследование по определению последовательности применения микробиологических и молекулярно-генетических методов в алгоритме ускоренной лабораторной диагностики туберкулеза. Установлены пороговые значения концентрации ДНК микобактерий туберкулеза (МБТ) в образцах различного диагностического материала для наиболее эффективного использования биочиповой технологии в определении лекарственной чувствительности МБТ к противотуберкулезным препаратам. Включение в алгоритм лабораторной диагностики туберкулеза микробиологического теста Sensititre MycoTB, наряду с тест-системой «ТБ-ТЕСТ», позволяет установить количественную характеризацию штаммов (уровень чувствительности/ устойчивости к широкому спектру АБП) для выбора препаратов и оптимизации проводимого лечения.

A study was carried out to determine the sequence of application of microbiological and molecular genetic methods in the algorithm for accelerated laboratory diagnosis of tuberculosis. We set threshold values of the concentration of DNA of Mycobacterium tuberculosis (MTB) in various diagnostic samples for the most effective application of microarrays technology in determining the drug susceptibility of MTB to anti-TB drugs. The inclusion of the Sensititre MycoTB microbiological test in the algorithm for laboratory diagnostics of tuberculosis together with the test-system “TB-TEST” makes it possible to establish the quantitative characterization of strains (the level of susceptibility/resistance to a wide range of antimicrobial agents) for the selection of anti-TB drugs and optimization of the treatment.

микобактерии туберкулезакультуральные методыметод серийных микроразведениймолекулярно-генетические методыопределение лекарственной чувствительностибиочипыПЦР в реальном времениMycobacterium tuberculosisculture methodsserial microdilution methodmolecular genetic methodsdrug susceptibility testingmicroarraysreal-time PCRReferencesБастиан И. Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (перевод с англ.) // Под ред. Ф. Порталс. – «Медицина и жизнь», 2003. – 368 с.Бастиан И. Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (перевод с англ.) // Под ред. Ф. Порталс. – «Медицина и жизнь», 2003. – 368 с.Богородская Е.М. Организация противотуберкулезной работы в городе Москве // Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу, 2019 г. / Под ред. Е.М. Богородской, В.И. Литвинова, Е.М Белиловского. – М.: МНПЦБТ, 2020. – С. 16-25.Богородская Е.М. Организация противотуберкулезной работы в городе Москве // Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу, 2019 г. / Под ред. Е.М. Богородской, В.И. Литвинова, Е.М Белиловского. – М.: МНПЦБТ, 2020. – С. 16-25.Борисов С.Е., Белиловский Е.М., Данилова И.Д., Рыбка Л.Н. Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя // Противотуберкулезная работа в городе Москве. Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу, 2019 г. / Под ред. Е.М. Богородской, В.И. Литвинова, Е.М. Белиловского. – М.: МНПЦБТ. – 2020. – Гл. 5. – С. 101-112.Борисов С.Е., Белиловский Е.М., Данилова И.Д., Рыбка Л.Н. Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя // Противотуберкулезная работа в городе Москве. Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу, 2019 г. / Под ред. Е.М. Богородской, В.И. Литвинова, Е.М. Белиловского. – М.: МНПЦБТ. – 2020. – Гл. 5. – С. 101-112.Мирзабеков, А.Д. Биочипы в биологии и медицине XXΙ века // Вестник РАН. – 2003. – Т. 73. – № 5. – С. 412.Мирзабеков, А.Д. Биочипы в биологии и медицине XXΙ века // Вестник РАН. – 2003. – Т. 73. – № 5. – С. 412.Носова Е.Ю., Михайлова Ю.Д., Перетокина И.В., Исакова А.А., Макарова М.В., Сафонова С.Г. Ускоренные методы определения устойчивости М.tuberculosis к химиопрепаратам. Надежность получаемых результатов. Материалы XI съезда фтизиатров России, 30 мая – 1 июня 2019, г. Владикавказ // Туберкулез и болезни легких. – 2019. – № 6. – С. 64-65.Носова Е.Ю., Михайлова Ю.Д., Перетокина И.В., Исакова А.А., Макарова М.В., Сафонова С.Г. Ускоренные методы определения устойчивости М.tuberculosis к химиопрепаратам. Надежность получаемых результатов. Материалы XI съезда фтизиатров России, 30 мая – 1 июня 2019, г. Владикавказ // Туберкулез и болезни легких. – 2019. – № 6. – С. 64-65.Abuali M., Katariwala R., LaBombardi V. A comparison of the Sensititre® MYCOTB panel and the agar proportion method for the susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 31. – N. 5. – P. 835-839.Abuali M., Katariwala R., LaBombardi V. A comparison of the Sensititre® MYCOTB panel and the agar proportion method for the susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 31. – N. 5. – P. 835-839.Angra P.K. Performance of tuberculosis drug susceptibilit testing in U.S. laboratories from 1994 to 2008 / P.K. Angra, T.H. Taylor, M.F. Iademarco, B. Metchock, J.R. Astles, J.C. Ridderhof // J. Clin. Microbiol. – 2012. – Vol. 50. – P. 1233-1239.Angra P.K. Performance of tuberculosis drug susceptibilit testing in U.S. laboratories from 1994 to 2008 / P.K. Angra, T.H. Taylor, M.F. Iademarco, B. Metchock, J.R. Astles, J.C. Ridderhof // J. Clin. Microbiol. – 2012. – Vol. 50. – P. 1233-1239.Banu S., Rahman M. M, Khan M., Ferdous S., Ahmed S., Gratz J., Stroup S., Pholwat S., Heysell S.K., Houptb E.R. Discordance across several methods for drug susceptibility testing of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in a single laboratory // J. Clin. Microbiol. – 2014. – Vol. 52. – N. 1. – P. 156-163.Banu S., Rahman M. M, Khan M., Ferdous S., Ahmed S., Gratz J., Stroup S., Pholwat S., Heysell S.K., Houptb E.R. Discordance across several methods for drug susceptibility testing of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in a single laboratory // J. Clin. Microbiol. – 2014. – Vol. 52. – N. 1. – P. 156-163.Gangadharam P.R., Pratt F.P., Perumal V.K., Iseman M.D. The effects of exposure time, drug concentration and temperature on the activity of ethambutol versus Mycobacterium tuberculosis // Am. Rev. Respir. Dis. – 1990. – Vol. 141. – P. 1478-1482.Gangadharam P.R., Pratt F.P., Perumal V.K., Iseman M.D. The effects of exposure time, drug concentration and temperature on the activity of ethambutol versus Mycobacterium tuberculosis // Am. Rev. Respir. Dis. – 1990. – Vol. 141. – P. 1478-1482.Hall L., Jude K.P., Clark S.L. et al. Evaluation of the Sensititre MycoTB Plate for Susceptibility Testing of the Mycobacterium tuberculosis сomplex against First- and Second-Line Agents // J.Clin.Microbiol. – 2012. – Vol. 50. – N. 11. – P. 3732-3734.Hall L., Jude K.P., Clark S.L. et al. Evaluation of the Sensititre MycoTB Plate for Susceptibility Testing of the Mycobacterium tuberculosis сomplex against First- and Second-Line Agents // J.Clin.Microbiol. – 2012. – Vol. 50. – N. 11. – P. 3732-3734.Kent, T.K. Public health mycobacteriology. A guide for the level III laboratory / T.K. Kent, G.P. Kubica // CDC, Atlanta. – 1985. – 150p.Kent, T.K. Public health mycobacteriology. A guide for the level III laboratory / T.K. Kent, G.P. Kubica // CDC, Atlanta. – 1985. – 150p.Kim S.J. Drug-susceptibility testing in tuberculosis: methods and reliability of results // Eur. Respir. J. – 2005. – Vol. 25. – P. 564–69.Kim S.J. Drug-susceptibility testing in tuberculosis: methods and reliability of results // Eur. Respir. J. – 2005. – Vol. 25. – P. 564–69.Miotto P., Piana F., Cirillo D.M., Migliori G.B. Genotype MTBDRplus: a Further step toward rapid identification of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 393-94.Miotto P., Piana F., Cirillo D.M., Migliori G.B. Genotype MTBDRplus: a Further step toward rapid identification of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 393-94.Rigouts, L. Rifampin Resistance Missed in Automated Liquid Culture System for Mycobacterium tuberculosis Isolates with Specific rpoB Mutations / L. Rigouts, M. Gumusboga, W. Bram de Rijk, E. Nduwamahoro, C. Uwizeye, B. de Jong, A. Van Deun // J. Clinical Microbiol. – 2013. – Vol. 51. – N. 8. – P. 2641-2645Rigouts, L. Rifampin Resistance Missed in Automated Liquid Culture System for Mycobacterium tuberculosis Isolates with Specific rpoB Mutations / L. Rigouts, M. Gumusboga, W. Bram de Rijk, E. Nduwamahoro, C. Uwizeye, B. de Jong, A. Van Deun // J. Clinical Microbiol. – 2013. – Vol. 51. – N. 8. – P. 2641-2645Schön, T. Evaluation of wild-type MIC distributions as a tool for determination of clinical breakpoints for Mycobacterium tuberculosis / T. Schön, P. Juréen, C.G. Giske, E. Chryssanthou, E. Sturegård, J. Werngren, G. Kahlmeter, S.E. Hoffner, K.A. Angeby // J. Antimicrob. Chemother. – 2009. – Vol. 64. – P. 786-793.Schön, T. Evaluation of wild-type MIC distributions as a tool for determination of clinical breakpoints for Mycobacterium tuberculosis / T. Schön, P. Juréen, C.G. Giske, E. Chryssanthou, E. Sturegård, J. Werngren, G. Kahlmeter, S.E. Hoffner, K.A. Angeby // J. Antimicrob. Chemother. – 2009. – Vol. 64. – P. 786-793.Siddiqi S.H., Rusch-Gerdes S., Alexander H. et al. MGIT TM Procedure Manual for BACTECTM MGITTM 960 TB System (Also applicable for Manual MGIT). Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) culture and drug susceptibility demonstration projects – 2007. Foundation for Innovative New Diagnostics, 2006. – 89 p.Siddiqi S.H., Rusch-Gerdes S., Alexander H. et al. MGIT TM Procedure Manual for BACTECTM MGITTM 960 TB System (Also applicable for Manual MGIT). Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) culture and drug susceptibility demonstration projects – 2007. Foundation for Innovative New Diagnostics, 2006. – 89 p.WHO. Policy guidance on drug-susceptibility testing (DST) of second-line antituberculosis drugs. Geneva, Switzerland: WHO, 2008. WHO/HTM/TB/2008.392.WHO. Policy guidance on drug-susceptibility testing (DST) of second-line antituberculosis drugs. Geneva, Switzerland: WHO, 2008. WHO/HTM/TB/2008.392.WHO. Сompanion handbook to the WHO guidelines for the programmatic management of drug-resistant tuberculosis. Chapter 3. Laboratory // Geneva: WHO. − 2014. − P. 39-60.WHO. Сompanion handbook to the WHO guidelines for the programmatic management of drug-resistant tuberculosis. Chapter 3. Laboratory // Geneva: WHO. − 2014. − P. 39-60.WHO. Technical report on critical concentrations for drug susceptibility testing of medicines used in the treatment of drug-resistant tuberculosis. WHO/CDS/TB/2018.5. – Geneva: WHO, 2018. [Электронный ресурс] URL: https://www.who.int/tb/publications/2018/concentrations-drug-susceptibility-testing-TB/en/ (Дата обращения 09.12.2019).WHO. Technical report on critical concentrations for drug susceptibility testing of medicines used in the treatment of drug-resistant tuberculosis. WHO/CDS/TB/2018.5. – Geneva: WHO, 2018. [Электронный ресурс] URL: https://www.who.int/tb/publications/2018/concentrations-drug-susceptibility-testing-TB/en/ (Дата обращения 09.12.2019).Zhang, Z. Ethambutol Resistance as Determined by Broth Dilution Method Correlates Better than Sequencing Results with embB Mutations in Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates / Z. Zhang, Y. Wang, Y. Pang, K.M. Kam // J. Clin. Microbiol. – 2014. - Vol. 52. – N. 2. – P. 638-641.Zhang, Z. Ethambutol Resistance as Determined by Broth Dilution Method Correlates Better than Sequencing Results with embB Mutations in Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates / Z. Zhang, Y. Wang, Y. Pang, K.M. Kam // J. Clin. Microbiol. – 2014. - Vol. 52. – N. 2. – P. 638-641.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.