tbjournalТуберкулез и социально значимые заболеванияTuberculosis and socially significant diseases2413-03462413-0354ООО «Ин-Тренд10.54921/2413-0346-2023-11-2-19-24tbjournal-88Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКАMICROBIOLOGICAL DIAGNOSTICSСмешанные популяции микобактерий у больных туберкулезом и микобактериозом: частота выявления и спектр видовMixed populations of mycobacteria in patients with tuberculosis and mycobacteriosis: frequency of detection and spectrum of speciesСмирноваТ. Г.SmirnovaT. G.

Смирнова Татьяна Геннадьевна – старший научный сотрудник отдела микробиологии, кандидат медицинских наук

Адрес: 107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

Тел. 8 (499) 785-90-91

s_tatka@mail.ruАндреевскаяС. Н.AndreevskayaS. N.

Андреевская Софья Николаевна – ведущий научный сотрудник отдела микробиологии, кандидат медицинских наук 

Адрес: 107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

Тел. 8 (499) 785-90-91

 

andsofia@mail.ruЛарионоваЕ. Е.LarionovaE.. E.

Ларионова Елена Евгеньевна – старший научный сотрудник отдела микробиологии, кандидат биологических наук 

Адрес: 107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

Тел. 8 (499) 785-90-91

larionova_lena@mail.ruЧерноусоваЛ. Н.ChernousovaL. N.

Черноусова Лариса Николаевна – главный научный сотрудник отдела микробиологии, профессор 

Адрес: 107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

Тел. 8 (499) 785-90-91

lchernousova@mail.ruЭргешовА. Э.ErgeshovA. Е.

Эргешов Атаджан – директор, член-корреспондент РАН, доктор медицинских наук, профессор 

Адрес: 107564, г. Москва, Яузская аллея, д. 2

Тел. 8 (499) 785-90-91

cniit@ctri.ruФГБНУ «Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза»Russian Federation2023300620231121924Copyright © Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Черноусова Л.Н., Эргешов А.Э., 20232023Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Черноусова Л.Н., Эргешов А.Э.Smirnova T.G., Andreevskaya S.N., Larionova E.E., Chernousova L.N., Ergeshov A.Е.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.tb-journal.ru/jour/article/view/88Введение

Введение. Смешанные микобактериальные инфекции являются актуальной для фтизиатрии и пульмонологии проблемой, которая изучена недостаточно.

Цель исследования

Цель исследования. Заключалась в оценке частоты выявления смешанных популяций микобактерий у больных туберкулезом и микобактериозом и определении видового состава этих популяций.

Материалы и методы

Материалы и методы. Исследованы клинические изоляты микобактерий, выделенные от 5531 пациента, находившегося на лечении или обратившегося за консультацией в ФГБНУ «ЦНИИТ». Культуру выделяли в системе автоматической регистрации роста культур BACTEC MGIT 960, видовую идентификацию проводили молекулярно-генетическими методами набором GenoType Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience, Германия) и/или набором, основанным на мультиплексной ПЦР в режиме реального времени.

Заключение о наличии смешанной популяции делали, если была выделена смесь из двух видов микобактерий на протяжении всего периода наблюдений или видовая структура популяции изменялась в динамике. Для оценки результатов исследования применяли описательную статистику, для определения значимых различий между группами использовали критерий χ; статистически значимыми считали различия при p < 0,05. Весь анализ проводили с помощью Microsoft Excel (Microsoft, США).

Результаты

Результаты. Частота выявления смешанной микобактериальной инфекции культуральным методом у пациентов фтизиатрических учреждений за период 2011–2023 гг. составляла 1,16%. Наиболее распространенными комбинациями видов были M. tuberculosis + M. avium и M. avium + M. intracellulare.

Introduction

Introduction. Mixed mycobacterial infections are an urgent problem for phthisiology and pulmonology, which has not been studied enough.

The aim of the study was to assess the frequency of detection of mixed populations of mycobacteria in patients with tuberculosis and mycobacteriosis and to determine the species composition of these populations.

Materials and methods

Materials and methods. Clinical isolates of mycobacteria isolated from 5531 patients who were treated or who sought advice from the FSBI «TSNIIT» were studied. The culture was isolated in the BACTEC MGIT 960 automatic crop growth registration system, species identification was carried out by molecular genetic methods using the GenoType Mycobacterium CM/AS kit (Hain Livescience, Germany) and/or a set based on multiplex PCR in real time. The conclusion about the presence of a mixed population was made if a mixture of two species of mycobacteria was isolated during the entire observation period or the species structure of the population changed dynamically. Descriptive statistics were used to evaluate the results of the study, the chi-squared criterion was used to determine significant differences between groups; differences were considered statistically significant at p < 0.05. The entire analysis was carried out using Microsoft Excel (Microsoft, USA).

Results

Results. The frequency of detection of mixed mycobacterial infection by culture method in patients of phthisiological institutions for the period 2011-2023 was 1.16%. The most common combinations of species were M. tuberculosis + M. avium and M. avium + M. intracellulare

микобактерии туберкулезанетуберкулезные микобактериисмешанная микобактериальная инфекциямикобактериозтуберкулезMycobacterium tuberculosisnon-tuberculosis mycobacteriummixed mycobacterium infectionmycobacteriosistuberculosisReferencesАндреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Смирнова Т.Г., Андриевская И.Ю., Киселева Е.А., Черноусова Л.Н. Лекарственная чувствительность медленнорастущих нетуберкулезных микобактерий // Туберкулез и болезни легких. – 2016. – Т. 94. – № 4. – С. 43-50.Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Смирнова Т.Г., Андриевская И.Ю., Киселева Е.А., Черноусова Л.Н. Лекарственная чувствительность медленнорастущих нетуберкулезных микобактерий // Туберкулез и болезни легких. – 2016. – Т. 94. – № 4. – С. 43-50.Гунтупова Л.Д., Борисов С.Е., Соловьева И.П. Микобактериозы во фтизиопульмонологической практике: обзор литературы и собственный опыт // Практическая медицина. – 2011. – Т. 51. – № 3. – С. 39-50.Гунтупова Л.Д., Борисов С.Е., Соловьева И.П. Микобактериозы во фтизиопульмонологической практике: обзор литературы и собственный опыт // Практическая медицина. – 2011. – Т. 51. – № 3. – С. 39-50.Демографический ежегодник России. 2021: Стат. сб. / Росстат. – M., 2021. – 256 c.Демографический ежегодник России. 2021: Стат. сб. / Росстат. – M., 2021. – 256 c.Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г., Черноусова Л.Н. Микробиологическая диагностика сопутствующей микобактериальной инфекции при фиброзном кистозе (муковисцидозе) // Уральский медицинский журнал. – 2018. – Т. 163. – № 8. – С. 65-68.Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г., Черноусова Л.Н. Микробиологическая диагностика сопутствующей микобактериальной инфекции при фиброзном кистозе (муковисцидозе) // Уральский медицинский журнал. – 2018. – Т. 163. – № 8. – С. 65-68.Литвинов В.И., Дорожкова И.Р., Макарова М.В., Краснова М.А., Фрейман Г.Е. Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий // Вестник РАМН. – 2010. – № 3. – С. 7-11.Литвинов В.И., Дорожкова И.Р., Макарова М.В., Краснова М.А., Фрейман Г.Е. Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий // Вестник РАМН. – 2010. – № 3. – С. 7-11.Петрова Л.В., Мельникова Е.И., Соловьев Ю.А., Ларионова Е.Е., Севастьянова Э.В. Выявление нетуберкулезных микобактерий в Республике Марий Эл // Туберкулез и болезни легких. – 2018. – Т. 96. – № 2 – С. 41-46.Петрова Л.В., Мельникова Е.И., Соловьев Ю.А., Ларионова Е.Е., Севастьянова Э.В. Выявление нетуберкулезных микобактерий в Республике Марий Эл // Туберкулез и болезни легких. – 2018. – Т. 96. – № 2 – С. 41-46.Приказ № 951 МЗ РФ от 29.12.2014. Об утверждении методических рекомендаций по совершенствованию диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания.Приказ № 951 МЗ РФ от 29.12.2014. Об утверждении методических рекомендаций по совершенствованию диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания.Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Устинова В.В., Черноусова Л.Н., Мониторинг видового разнообразия нетуберкулезных микобактерий в ряде областей РФ с использованием ДНК-стрипов Genotype Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience, Германия) // Туберкулез и болезни легких. – 2017. – Т. 95. – № 5. – С. 54-59.Смирнова Т.Г., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Андриевская И.Ю., Устинова В.В., Черноусова Л.Н., Мониторинг видового разнообразия нетуберкулезных микобактерий в ряде областей РФ с использованием ДНК-стрипов Genotype Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience, Германия) // Туберкулез и болезни легких. – 2017. – Т. 95. – № 5. – С. 54-59.Старение и здоровье. Информационный бюллетень ВОЗ от 1 октября 2022 г. [Электронный ресурс] URL: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/ageing-and-health. (Дата обращения 07.07.2023).Старение и здоровье. Информационный бюллетень ВОЗ от 1 октября 2022 г. [Электронный ресурс] URL: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/ageing-and-health. (Дата обращения 07.07.2023).Старкова Д.А., Журавлев Ю.В., Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Куликова О.Н., Нарвская О.В. Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий у больных микобактериозом на территориях Северо-Западного федерального округа России // Туберкулез и болезни легких. – 2019. – Т. 97. – № 6. – С. 16-23.Старкова Д.А., Журавлев Ю.В., Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Куликова О.Н., Нарвская О.В. Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий у больных микобактериозом на территориях Северо-Западного федерального округа России // Туберкулез и болезни легких. – 2019. – Т. 97. – № 6. – С. 16-23.Суркова Л.К., Залуцкая О.М., Скрягина Е.М., Николенко Е.Н., Яцкевич Н.В., Стринович А.Л., Шаламовский В.В. Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий и диагностика микобактериоза легких в Республике Беларусь // Клиническая инфектология и паразитология. – 2020. – Т. 9. – № 2. – С. 161-169.Суркова Л.К., Залуцкая О.М., Скрягина Е.М., Николенко Е.Н., Яцкевич Н.В., Стринович А.Л., Шаламовский В.В. Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий и диагностика микобактериоза легких в Республике Беларусь // Клиническая инфектология и паразитология. – 2020. – Т. 9. – № 2. – С. 161-169.Bazzi A.M., Abulhamayel Y., Rabaan A.A., Al-Tawfiq J.A. The impact of the coexistence of mycobacterium avium with mycobacterium tuberculosis on the result of GeneXpert and MGIT susceptibility test // J. Infect. Public Health. – 2020. – Vol. 13. – N. 5. – P. 827-829.Bazzi A.M., Abulhamayel Y., Rabaan A.A., Al-Tawfiq J.A. The impact of the coexistence of mycobacterium avium with mycobacterium tuberculosis on the result of GeneXpert and MGIT susceptibility test // J. Infect. Public Health. – 2020. – Vol. 13. – N. 5. – P. 827-829.Chanda-Kapata P., Kapata N., Klinkenberg E., Mulenga L., Tembo M., Katemangwe P., Sunkutu V., Mwaba P., Grobusch M.P. Non-tuberculous mycobacteria (NTM) in Zambia: prevalence, clinical, radiological, and microbiological characteristics // BMC Infect. Dis. – 2015. – Vol. 15. – 500.Chanda-Kapata P., Kapata N., Klinkenberg E., Mulenga L., Tembo M., Katemangwe P., Sunkutu V., Mwaba P., Grobusch M.P. Non-tuberculous mycobacteria (NTM) in Zambia: prevalence, clinical, radiological, and microbiological characteristics // BMC Infect. Dis. – 2015. – Vol. 15. – 500.Global tuberculosis report 2022 / Geneva: World Health Organization, 2022. – 53 p.Global tuberculosis report 2022 / Geneva: World Health Organization, 2022. – 53 p.Gupta R.S., Lo B., Son J. Phylogenomics and comparative genomic studies robustly support division of the genus mycobacterium into an emended genus mycobacterium and four novel genera // Front. Microbiol. – 2018. – Vol. 13. – N. 9. – P. 67.Gupta R.S., Lo B., Son J. Phylogenomics and comparative genomic studies robustly support division of the genus mycobacterium into an emended genus mycobacterium and four novel genera // Front. Microbiol. – 2018. – Vol. 13. – N. 9. – P. 67.Henkle E., Hedberg K., Schafer S., Novosad S., Winthrop K.L. Population-based incidence of pulmonary nontuberculous mycobacterial disease in Oregon 2007 to 2012 // Ann. Am. Thor. Soc. – 2015. – Vol. 12. – P. 642–647.Henkle E., Hedberg K., Schafer S., Novosad S., Winthrop K.L. Population-based incidence of pulmonary nontuberculous mycobacterial disease in Oregon 2007 to 2012 // Ann. Am. Thor. Soc. – 2015. – Vol. 12. – P. 642–647.Ide S., Nakamura S., Yamamoto Y., Kohno Y., Fukuda Y., Ikeda H., Sasaki E., Yanagihara K., Higashiyama Y., Hashiguchi K., Futsuki Y., Inoue Y., Fukushima K., Suyama N., Kohno S. Epidemiology and clinical features of pulmonary nontuberculous mycobacteriosis in Nagasaki, Japan // PloS One. – 2015. – Vol. 10. – e 0128304Ide S., Nakamura S., Yamamoto Y., Kohno Y., Fukuda Y., Ikeda H., Sasaki E., Yanagihara K., Higashiyama Y., Hashiguchi K., Futsuki Y., Inoue Y., Fukushima K., Suyama N., Kohno S. Epidemiology and clinical features of pulmonary nontuberculous mycobacteriosis in Nagasaki, Japan // PloS One. – 2015. – Vol. 10. – e 0128304Ishiekwene C., Subran M., Ghitan M., Kuhn-Basti M., Chapnick E., Lin Y.S. Case report on pulmonary disease due to coinfection of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium abscessus: Difficulty in diagnosis // Respir. Med. Case Rep. – 2017. – Vol. 20. – P. 123-124.Ishiekwene C., Subran M., Ghitan M., Kuhn-Basti M., Chapnick E., Lin Y.S. Case report on pulmonary disease due to coinfection of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium abscessus: Difficulty in diagnosis // Respir. Med. Case Rep. – 2017. – Vol. 20. – P. 123-124.Jain S., Sankar M.M., Sharma N., Singh S., Chugh T.D. High prevalence of non-tuberculous mycobacterial disease among non-HIV infected individuals in a TB endemic country–experience from a tertiary center in Delhi, India // Pathog. Glob. Health. – 2014. – Vol. 108. – P. 118–122.Jain S., Sankar M.M., Sharma N., Singh S., Chugh T.D. High prevalence of non-tuberculous mycobacterial disease among non-HIV infected individuals in a TB endemic country–experience from a tertiary center in Delhi, India // Pathog. Glob. Health. – 2014. – Vol. 108. – P. 118–122.Jarand J., Levin A., Zhang L., Huitt G., Mitchell J.D., Daley C.L. Clinical and microbiologic outcomes in patients receiving treatment for Mycobacterium abscessus pulmonary disease // Clin. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 52. – N. 5. – P. 565-571.Jarand J., Levin A., Zhang L., Huitt G., Mitchell J.D., Daley C.L. Clinical and microbiologic outcomes in patients receiving treatment for Mycobacterium abscessus pulmonary disease // Clin. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 52. – N. 5. – P. 565-571.Jun H.J., Jeon K., Um S.W., Kwon O.J., Lee N.Y., Koh W.J. Nontuberculous mycobacteria isolated during the treatment of pulmonary tuberculosis // Respir. Med. – 2009. – Vol. 103. – P. 1936-1940.Jun H.J., Jeon K., Um S.W., Kwon O.J., Lee N.Y., Koh W.J. Nontuberculous mycobacteria isolated during the treatment of pulmonary tuberculosis // Respir. Med. – 2009. – Vol. 103. – P. 1936-1940.Kim J.S., Tanaka N., Newell J.D., Degroote M.A., Fulton K., Huitt G., Lynch D.A. Nontuberculous mycobacterial infection: CT scan findings, genotype, and treatment responsiveness // Chest. – 2005. – Vol. 128. – N. 6. – P. 3863-3869.Kim J.S., Tanaka N., Newell J.D., Degroote M.A., Fulton K., Huitt G., Lynch D.A. Nontuberculous mycobacterial infection: CT scan findings, genotype, and treatment responsiveness // Chest. – 2005. – Vol. 128. – N. 6. – P. 3863-3869.Kurahara Y., Tachibana K., Tsuyuguchi K., Suzuki K. Mixed pulmonary infection with three types of nontuberculous mycobacteria // Intern. Med. – 2013. – Vol. 52. – N. 4. – P. 507-510.Kurahara Y., Tachibana K., Tsuyuguchi K., Suzuki K. Mixed pulmonary infection with three types of nontuberculous mycobacteria // Intern. Med. – 2013. – Vol. 52. – N. 4. – P. 507-510.Lin C.K., Yang Y.H., Lu M.L., Tsai Y.H., Hsieh M.J., Lee Y.C., Wang T.N., Chen Y.L., Chen V.C. Incidence of nontuberculous mycobacterial disease and coinfection with tuberculosis in a tuberculosis-endemic region: A population-based retrospective cohort study // Medicine (Baltimore). – 2020. – Vol. 99. – N. 52. – e 23775.Lin C.K., Yang Y.H., Lu M.L., Tsai Y.H., Hsieh M.J., Lee Y.C., Wang T.N., Chen Y.L., Chen V.C. Incidence of nontuberculous mycobacterial disease and coinfection with tuberculosis in a tuberculosis-endemic region: A population-based retrospective cohort study // Medicine (Baltimore). – 2020. – Vol. 99. – N. 52. – e 23775.Nasiri M.J., Dabiri H., Darban-Sarokhalil D., Hashemi Shahraki A. Prevalence of nontuberculosis mycobacterial infections among tuberculosis suspects in Iran: systematic review and meta-analysis // PloS One. – 2015. – Vol. 10. – e0129073.Nasiri M.J., Dabiri H., Darban-Sarokhalil D., Hashemi Shahraki A. Prevalence of nontuberculosis mycobacterial infections among tuberculosis suspects in Iran: systematic review and meta-analysis // PloS One. – 2015. – Vol. 10. – e0129073.Park S.C., Kang M.J., Han C.H., Lee S.M., Kim C.J., Lee J.M., Kang Y.A. Prevalence, incidence, and mortality of nontuberculous mycobacterial infection in Korea: a nationwide population-based study // BMC Pulm. Med. – 2019. – Vol. 19. – N. 1. – 140.Park S.C., Kang M.J., Han C.H., Lee S.M., Kim C.J., Lee J.M., Kang Y.A. Prevalence, incidence, and mortality of nontuberculous mycobacterial infection in Korea: a nationwide population-based study // BMC Pulm. Med. – 2019. – Vol. 19. – N. 1. – 140.Shah N.M., Davidson J.A., Anderson L.F., Lalor M.K., Kim J., Thomas H.L., Lipman M., Abubakar I. PulmonaryMycobacterium avium-intracellulare is the main driver of the rise in non-tuberculous mycobacteria incidence in England, Wales and Northern Ireland, 2007-2012 // BMC Infect. Dis. – 2016. – Vol. 16. – 195.Shah N.M., Davidson J.A., Anderson L.F., Lalor M.K., Kim J., Thomas H.L., Lipman M., Abubakar I. PulmonaryMycobacterium avium-intracellulare is the main driver of the rise in non-tuberculous mycobacteria incidence in England, Wales and Northern Ireland, 2007-2012 // BMC Infect. Dis. – 2016. – Vol. 16. – 195.Shahraki A.H., Heidarieh P., Bostanabad S.Z., Khosravi A.D., Hashemzadeh M., Khandan S., Biranvand M., Schraufnagel D.E., Mirsaeidi M. «Multidrug-resistant tuberculosis» may be nontuberculous mycobacteria // Eur. J. Intern. Med. – 2015. – Vol. 26. – P. 279-284.Shahraki A.H., Heidarieh P., Bostanabad S.Z., Khosravi A.D., Hashemzadeh M., Khandan S., Biranvand M., Schraufnagel D.E., Mirsaeidi M. «Multidrug-resistant tuberculosis» may be nontuberculous mycobacteria // Eur. J. Intern. Med. – 2015. – Vol. 26. – P. 279-284.Smirnova T., Ustinova V., Andreevskaya S., Larionova E., Kiseleva E., Chernousova L., Varlamov D., Sochivko D., Ergeshov A. Evaluation of a new assay for nontuberculous mycobacteria species identification in diagnostic material and cultures // Tuberculosis (Edinb). – 2021. – Vol. 130. – 102124.Smirnova T., Ustinova V., Andreevskaya S., Larionova E., Kiseleva E., Chernousova L., Varlamov D., Sochivko D., Ergeshov A. Evaluation of a new assay for nontuberculous mycobacteria species identification in diagnostic material and cultures // Tuberculosis (Edinb). – 2021. – Vol. 130. – 102124.Thomson R.M. Changing epidemiology of pulmonary nontuberculous mycobacteria infections // Emerg. Infec.t Dis. – 2010. – Vol. 16. – P. 1576–1583.Thomson R.M. Changing epidemiology of pulmonary nontuberculous mycobacteria infections // Emerg. Infec.t Dis. – 2010. – Vol. 16. – P. 1576–1583.Van der Werf M.J., Ködmön C., Katalinić-Janković V., Kummik T., Soini H., Richter E., Papaventsis D., Tortoli E., Perrin M., van Soolingen D., Žolnir-Dovč M., Thomsen V.Ø. Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union // BMC Infect. Dis. – 2014. – Vol. 14. – P. 62Van der Werf M.J., Ködmön C., Katalinić-Janković V., Kummik T., Soini H., Richter E., Papaventsis D., Tortoli E., Perrin M., van Soolingen D., Žolnir-Dovč M., Thomsen V.Ø. Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union // BMC Infect. Dis. – 2014. – Vol. 14. – P. 62

The authors declare that there are no conflicts of interest present.