Ранняя диагностика туберкулеза с использованием теста Xpert MTB/Rif Ultra

Цель. Оценить диагностическую эффективность молекулярно-генетического теста Xpert MTB/RIF Ultra в отношении выявления возбудителя туберкулеза и определения его чувствительности к рифампицину в различном диагностическом материале.
Материалы и методы. Исследованы 427 образцов респираторного и внелегочного диагностического материала, полученного от 378 пациентов, нуждающихся в ускоренной диагностике туберкулеза (ТБ), в том числе больных ВИЧ-инфекцией. Исследование проводили из одной порции осадка обработанного диагностического материала с помощью люминесцентной микроскопии, бактериологического метода (посевов в жидкой среде Middlebrook 7H9 в системе Bactec MGIT 960, на плотной питательной среде Левенштейна – Йенсена) и теста Xpert MTB/RIF Ultra.
Результаты. Продемонстрирована высокая эффективность тест-системы Xpert MTB/RIF Ultra при верификации ТБ у пациентов с различным ВИЧ-статусом с подозрением на заболевание или рецидив. Показана высокая выявляемость ДНК M. tuberculosis (39,2%, 95%ДИ 32,6–46,2%) из разного диагностического материала, в том числе при отрицательных результатах микроскопии и посева на питательных средах у больных с подтвержденным диагнозом ТБ. Использование для тестирования лекарственной чувствительности M. tuberculosis к рифампицину критической концентрации 0,5 мкг/мл, рекомендованной ВОЗ, позволило бы повысить установленное значение совпадений результатов тестирования в системе Bactec MGIT 960 с Xpert MTB/Rif Ultra до 97,4% (95% ДИ 86,8–99,5).

1. Бородулина Е.А., Пискун В.В., Ураксина М.В, Шубина А.Т. Молекулярно-генетические тесты GENEXPERT MTB/RIF и XPERT MTB/RIF (ULTRA) в диагностике туберкулеза: обзор литературы // Клиническая лабораторная диагностика. – 2022. – № 2. 67(9). – С. 544-549.

2. Приказ Минздрава России от 21.03.2003 № 109 (ред. от 05.06.2017) «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации». – Электронный ресурс: https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_100829/

3. Чункаева Д.Д., Чингисова Л.Т., Коптлеуова А.Б. и др. Эффективность XPERT MTB/RIF ULTRA для диагностики туберкулеза: обзор литературы) // Фтизиопульмонология. – 2022. – № 1(39) – С. 163-168.

4. Эпидемиологические показатели по туберкулезу в г. Москве по итогам 2023 года. – Электронный ресурс https://mnpcbt.ru/epidSituation/epid-pokazateli-po-tb-itog-2023/

5. Andama A., Jaganath D. et al. The transition to Xpert MTB/RIF ultra: diagnostic accuracy for pulmonary tuberculosis in Kampala, Uganda // BMC Infect. Dis. – 2021. – Vol. 21, No 49. – P. 1-7. https://doi.org/10.1186/s12879-020-05727-8doi:10.1186/s12879-020-05727-8.

6. Boehme C.C., Nabeta P., Hillemann D. et al. Rapid molecular detection of tuberculosis and rifampin resistance // N. Engl. J. Med. – 2010. – Vol. 363. – P. 1005-1015.

7. Chakravorty S., Simmons A.M., Rowneki M. et al. The new Xpert MTB/RIF Ultra: improving detection of Mycobacterium tuberculosis and resistance to rifampin in an assay suitable forPoint-of-Care testing // mBio. – 2017. – Vol. 8, No 4. – P. e00812. – e00817. doi:10.1128/mBio.00812-17.

8. Chilukutu L., Mwanza W., Kerkhoff A.D. et al. Prevalence and interpretation of Xpert® Ultra trace results among presumptive TB patients // Public Health Action. – 2022 – Vol. 12, No 1 – P. 28-33.

9. Denkinger C.M., Schumacher S.G., Boehme C.C. et al. Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis: a systematic review and meta-analysis // Eur. Respir. J. – 2014. – Vol. 44. – P. 435-446. https://doi.org/10.1183/09031936.00007814

10. Huang T.-S., Chen C.S., Lee S.S. et al. Comparison of the BACTEC MGIT 960 and BACTEC 460TB Systems for Detection of mycobacteria in Clinical Specimens // Ann. Clin. Lab. Sci. – 2001. – Vol. 31, No 3. – P. 279-283.

11. Marlowe E., Novak-Weekley S.M., Cumpio J. et al. Evaluation of the Cepheid Xpert MTB/RIF assay for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex in respiratory specimens // J. Clin. Microbiol. – 2011. – Vol. 49. – P. 1621-1623.

12. Rigouts L., Gumusboga M., Bram de Rijk W. et al. Rifampin resistance missed in automated liquid culture system for Mycobacterium tuberculosis isolates with specific rpoB mutations // J. Clinical Microbiol. – 2013. – Vol. 51, No 8. – P. 2641-2645.

13. Siddiqi S. MGIT Procedure Manual for BactecTM MGITTM 960 TB System (also applicable for Manual MGIT) Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) Culture and Drug Susceptibility Demonstration Projects. - 2007.

14. Steingart K.R., Schiller I., Horne D.J. et al. Xpert® MTB/RIF assay for pulmonary tuberculosis and rifampicin resistance in adults // Cochrane Database Syst. Rev. – 2014. – No 1. – CD009593. https://doi.org/10 .1002/14651858.CD009593.pub3.

15. Тheron G., Peter J., Calligaro G. et al. Determinants of PCR performance (Xpert MTB/RIF), including bacterial load and inhibition, for TB diagnosis using specimens from different body compartments // Sci. Rep. – 2014. – No 4. – P. 1-10. doi: 10.1038/srep05658.

16. Williams-Bouyer N., Yorke R., Lee H.I., Woods G.L. Comparison of the BACTEC MGIT 960 and ESP culture system II for growth and detection of mycobacteria // J. Clin. Microbiol. – 2000. – Vol. 38, No 11. – P. 4167-4170.

17. WHO meeting report of a technical expert consultation: non-inferiority analysis of Xpert MTF/RIF Ultra compared to Xpert MTB/RIF / WHO/HTM/TB/2017.04. Licence: CC BY-NCSA 3. – Geneva: World Health Organization, 2017.

18. World Health Organization. Technical Report on critical concentrations for drug susceptibility testing of isoniazid and the rifamycins (rifampicin, rifabutin and rifapentine) – Geneva: WHO, 2021.

19. World Health Organization. Global tuberculosis report. – Geneva: WHO, 2023. – 57 р. Электронный ресурс: https://www.who.int/teams/global-tuberculosis-programme/tb-reports/global-tuberculosis-report-2023.

20. Zeka A.N., Tasbakan S., Cavusoglu C. Evaluation of the GeneXpert MTB/RIF assay for rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin resistance in pulmonary and extrapulmonary specimens // J. Clin. Microbiol. – 2014. – Vol. 49. – P. 4138-414.