Изучение лекарственной чувствительности к бедаквилину быстрорастущих микобактерий комплекса М. chelonae – M. abscessus

Введение. Микобактерии комплекса М. chelonae – abscessus (в первую очередь М. abscessus) являются наиболее частыми возбудителями микобактериозов среди быстрорастущих нетуберкулезных микобактерий (НТМБ).

Материалы и методы. Изучена ЛЧ к бедаквилину комплекса M. Chelonae – М. abscessus (43 – М. chelonae и 64 – М. abscessus). Исследование проводили методом серийных микроразведений в жидкой питательной среде Мюллера-Хинтона с использованием 96-луночного планшета.

Результаты исследования. Спектр МИК бедаквилина в отношении М. chelonae и М. abscessus был определен в диапазоне 0,0015–2,0 мкг/мл и 0,0015–1,0 мкг/мл. МИК50 для М. chelonae и М. abscessus составил 0,015 и 0,007 мкг/мл, МИК90 – 0,12 и 0,06 мкг/мл соответственно. Установленные предварительные эпидемиологические пограничные значения (ECOFF) для клинических изолятов М. chelonae и М. abscessus составили 0,25 и 0,12 мкг/мл соответственно. Устойчивость к бедаквилину была обнаружена у 1 штамма М. chelonae и 2 штаммов М. abscessus.

Заключение. Показатели ЛЧ к бедаквилину М. chelonae и М. abscessus в разных исследованиях различаются, что является отражением взаимодействия возбудителя и макроорганизма в разных условиях влияния среды. Но развитие таких исследований необходимо для создания в итоге реальных критериев оценки ЛЧ к бедаквилину

1. Богородская Е.М., Кудлай Д.А., Литвинов В.И. Проблемы лекарственной устойчивости микобактерий / Под ред. Е.М. Богородской, Д.А. Кудлая, В.И. Литвинова // М.: МНПЦБТ. – 2021. – 504 с.

2. Борисов С.Е., Иванушкина Т.Н., Иванова Д.А., Филиппов А.В., Литвинова Н.В., Родина О.В., Гармаш Ю.Ю., Сафонова С.Г., Богородская Е.М. Эффективность и безопасность включающих бедаквилин шестимесячных режимов химиотерапии у больных туберкулезом органов дыхания // Туберкулез и социально значимые заболевания. – 2015. – № 3. – С. 30-49.

3. Борисов С.Е., Филиппов А.В., Иванова Д.А., Иванушкина Т.Н., Литвинова Н.В., Гармаш Ю.Ю. Эффективность и безопасность основанных на использовании бедаквилина режимов химиотерапии у больных туберкулезом органов дыхания: непосредственные и окончательные результаты // Туберкулез и болезни легких. – 2019. – Т. 97. – № 5. – С. 28-42.

4. Литвинов В.И., Богородская Е.М., Борисов С.Е. Нетуберкулезные микобактерии, микобактериозы / Под ред. В.И. Литвинова, Е.М. Богородской, С.Е. Борисова // М.: МНПЦБТ, 2014. – 256 с.

5. Морозова Т.И., Отпущенникова О.Н., Докторова Н.П., Данилов А.Н. Опыт применения препарата бедаквилин в лечении больных туберкулезом легких с лекарственной устойчивостью возбудителя // Туберкулез и болезни легких. – 2016. – Т. 94. – № 2. – С. 29-35.

6. Перетокина И.В., Крылова Л.Ю., Михайлова Ю.Д., Свириденко М.А., Хахалина А.А., Сафонова С.Г. Изучение взаимосвязи значений минимальных ингибирующих концентраций бедаквилина в отношении Mycobacterium tuberculosis, выделенных от впервые выявленных больных, с наличием чувствительности/устойчивости к ПТП и их принадлежностью к генетическим семействам // Туберкулез и социально-значимые заболевания. – 2021. – № 4. – С. 17-26.

7. Тихонов А.М., Буракова М.В., Ваниев Э.В., Романов В.В., Васильева И.А. Эффективность химиотерапии с применением бедаквилина у больных туберкулезом легких с лекарственной устойчивостью возбудителя // Туберкулез и болезни легких. – 2018. – Т. 96. – № 2. – С. 22-26.

8. Aguilar-Ayala D., Cnockaert M., André E., Andries K., Gonzalez-Y-Merchand J., Vandamme P. et al. In vitro activity of bedaquiline against rapidly growing nontuberculous mycobacteria // J. Med. Microbiol. – 2017. – Vol. 66. – N. 8. – P. 1140-1143. doi: 10.1099/jmm.0.000537.

9. Ahmad N., Ahuja S., Akkerman O., Alffenaar J., Anderson L., Baghaei P. et al. Treatment correlates of successful outcomes in pulmonary multidrug-resistant tuberculosis: an individual patient data meta-analysis Collaborative Group for the Meta-Analysis of Individual Patient Data in MDR-TB treatment – 2017 // Lancet. – 2018. – N. 392 (10150). – P. 821-834. doi: 10.1016/S0140-6736(18)31644-1.

10. Andries K., Verhasselt P., Guillemont J., Göhlmann H., Neefs J. et al. A diarylquinoline drug active on the ATP synthase of Mycobacterium tuberculosis // Science. – 2005. – N. 307 (5707). – P. 223-227. doi: 10.1126/science.1106753.

11. Andries K., Villellas C., Coeck N., Thys K., Gevers T., Vranckx L. et al. Acquired resistance of Mycobacterium tuberculosis to bedaquiline // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. – N. 7:e102135. doi: 10.1371/journal.pone.0102135.

12. Asami T., Aono A., Chikamatsu K., Igarashi Y., Morishige Y., Murase Y. et al. Efficacy estimation of a combination of triple antimicrobial agents against clinical isolates of Mycobacterium abscessus subsp. abscessus in vitro // JAC Antimicrob. Resist. – 2021. – N. 3:dlab004. doi: 10.1093/jacamr/dlab004.

13. Benwill J., Wallace R. Mycobacterium abscessus: challenges in diagnosis and treatment // Curr. Opin. Infect. Dis. – 2014. – N. 6. – P. 506-510. doi: 10.1097/QCO.0000000000000104.

14. Brown-Elliott B., Nash K., Wallace R. Antimicrobial susceptibility testing, drug resistance mechanisms, and therapy of infections with nontuberculous mycobacteria // Clin. Microbiol. Rev. – 2012. – Vol. 25. – N. 3. – P. 545-582. doi: 10.1128/CMR.05030-11.

15. Brown-Elliott B., Philley J. Rapidly Growing Mycobacteria // Microbiol. Spectr. – 2017 (а). – N. 1. doi: 10.1128/microbiolspec.TNMI7-0027-2016.

16. Brown-Elliott B., Philley J., Griffith D., Thakkar F., Wallace R. In vitro susceptibility testing of bedaquiline against Mycobacterium avium complex // Antimicrob Agents Chemother. – 2017 (b). – Vol. 61. – N. 2:e01798-16. doi: 10.1128/AAC.01798-16.

17. Brown-Elliott B., Wallace R. In vitro susceptibility testing of bedaquiline against Mycobacterium abscessus complex // Antimicrob. Agents Chemother. – 2019. – Vol. 63:e01919-18. doi: 10.1128/AAC.01919-18.

18. Chew K., Octavia S., Go J., Ng S., Tang Y., Soh P. et al. In vitro susceptibility of Mycobacterium abscessus complex and feasibility of standardizing treatment regimens // J. Antimicrob. Chemother. – 2021. – Vol. 76. – N. 4. – P. 973-978. doi: 10.1093/jac/dkaa520.

19. CLSI. Clinical and Laboratory Standards Institute. Susceptibility testing of mycobacteria, nocardiae, and other aerobic actinomycetes; approved standard – second edition: document M24-A2. CLSI, Wayne, PA, USA, 2011. 20. CLSI. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Susceptibility testing of mycobacteria, Nocardia spp., and other aerobic actinomycetes. (3rd ed.), CLSI, Wayne, PA, USA, 2018.

20. Daley C., Iaccarino J., Lange C., Cambau E., Wallace R. Andrejak C. et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: an official ATS/ERS/ ESCMID/IDSA clinical practice guideline // Eur. Respir. J. – 2020. – Vol. 56. – N. 1:2000535. doi: 10.1183/13993003.00535-2020.

21. Degiacomi G., Sammartino J., Chiarelli L., Riabova O., Makarov V., Pasca M. Mycobacterium abscessus, an emerging and worrisome pathogen among cystic fibrosis patients // Int. J. Mol. Sci. – 2019. – Vol. 20. – N. 23:5868. doi: 10.3390/ijms20235868.

22. Diacon A., Pym A., Grobusch M., de los Rios J., Gotuzzo E., Vasilyeva I. et al. TMC207-C208 Study Group. Multidrug-resistant tuberculosis and culture conversion with bedaquiline // N. Engl. J. Med. – 2014. – Vol. 371. – N. 8. – P. 723-732. doi: 10.1056/NEJMoa1313865.

23. Dupont C., Viljoen A., Thomas S., Roquet-Banères F., Herrmann J., Pethe K. et al. Bedaquiline inhibits the ATP synthase in Mycobacterium abscessus and is effective in infected zebrafish // Antimicrob. Agents Chemother. – 2017. – Vol. 61:e01225-17. doi: 10.1128/AAC.01225-17.

24. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. EUCAST subcommittee on MIC distributions and epidemiological cut-off values (ECOFFs). 2014. [Электронный ресурс] URL: http://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Consultation/2017/MIC_and_ECOFF/EUCAST_MIC_and_ ECOFF_discussion_document_version_3_20170309.pdf. (Дата обращения 01.11.2022).

25. Flume P., Griffith D., Chalmers J., Daley C., Olivier K., O’Donnell A. et al. Development of drugs for nontuberculous mycobacterial disease: clinicians’ interpretation of a US Food and Drug Administration Workshop // Chest. – 2021. – Vol. 159. – N. 2. – P. 537-543. doi: 10.1016/j.chest.2020.08.2055.

26. Gonzalez-Santiago T., Drage L. Nontuberculous mycobacteria: skin and soft tissue infections // Dermatol. Clin. – 2015. – Vol. 33. – N. 3. – P. 563-577. doi: 10.1016/j.det. 2015.03.017

27. Griffith D., Aksamit T., Brown-Elliott B., Catanzaro A., Daley C., Gordin F. et al. ATS Mycobacterial Diseases Subcommittee; American Thoracic Society; Infectious Disease Society of America. An official ATS/IDSA statement: diagnosis, treatment, and prevention of nontuberculous mycobacterial diseases // Am. J. Respir. Crit. Care Med. – 2007. – Vol. 175. – N. 4. – P. 367-416. doi: 10.1164/rccm.200604-571ST.

28. Griffith D., Daley C. Treatment of Mycobacterium abscessus pulmonary disease // Chest. – 2022. – Vol. 161. – N. 1. – P. 64-75. doi: 10.1016/j.chest.2021.07.035.

29. Guglielmetti L., Mougari F., Lopes A., Raskine L., Cambau E. Human infections due to nontuberculous mycobacteria: the infectious diseases and clinical microbiology specialists’ point of view // Future Microbiol. – 2015. – Vol. 10. – N. 9. – P. 1467-1483. doi: 10.2217/fmb.15.64.

30. Guglielmetti L., Chiesi S., Eimer J., Dominguez J., Masini T. et al. Bedaquiline and delamanid for drug-resistant tuberculosis: a clinician’s perspective // Future Microbiol. – 2020. – Jun; 15. – P. 779-799. doi: 10.2217/fmb-2019-0309.

31. Gumbo T., Cirrincione K., Srivastava S. Repurposing drugs for treatment of Mycobacterium abscessus: a view to a kill // J. Antimicrob. Chemother. – 2020. – Vol. 75. – N. 5. – P. 1212-1217. doi: 10.1093/jac/dkz523.

32. Hards K., Robson J., Berney M., Shaw L., Bald D., Koul A. et al. Bactericidal mode of action of bedaquiline // J. Antimicrob. Chemother. – 2015. – Vol. 70. – N. 7. – P. 2028-2037. doi: 10.1093/jac/dkv054.

33. Huitric E., Verhasselt P., Andries K., Hoffner S. In vitro antimycobacterial spectrum of a diarylquinoline ATP synthase inhibitor // Antimicrob. Agents Chemother. – 2007. – Vol. 51. – N. 11. – P. 4202-4204. doi: 10.1128/AAC.00181-07.

34. Hypolite T., Grant-Kels J., Chirch L. Nontuberculous mycobacterial infections: a potential complication of cosmetic procedures // Int. J. Womens Dermatol. –2015. – Vol. 1. – N. 1. – P. 51-54. doi: 10.1016/j.ijwd.2014.12.007.

35. Johansen M., Herrmann J., Kremer L. Non-tuberculous mycobacteria and the rise of Mycobacterium abscessus // Nat. Rev. Microbiol. – 2020. – N. 7. – P. 392-407. doi: 10.1038/s41579-020-0331-1.

36. Kim D., Jhun B., Moon S., Kim S., Jeon K., Kwon O. et al. In vitro activity of bedaquiline and delamanid against nontuberculous mycobacteria, including macrolide-resistant clinical isolates // Antimicrob. Agents Chemother. – 2019. – Vol. 63:e00665-19. doi: 10.1128/AAC.00665-19.

37. Koh W. Nontuberculous Mycobacteria-Overview // Microbiol. Spectr. – 2017. – N. 1. doi: 10.1128/microbiolspec.TNMI7-0024-2016.

38. Kumar C., Shrivastava K., Singh A., Chauhan V., Varma-Basil M. Skin and soft-tissue infections due to rapidly growing mycobacteria: An overview // Int. J. Mycobacteriol. – 2021. – N. 3. – P. 293-300. doi: 10.4103/ijmy.ijmy_110_21.

39. Le Moigne V., Raynaud C., Moreau F., Dupont C., Nigou J., Neyrolles O. et al. Efficacy of bedaquiline, alone or in combination with imipenem, against Mycobacterium abscessus in C3HeB/FeJ Mice // Antimicrob. Agents Chemother. – 2020. – Vol. 64. – N. 6:e00114-20. doi: 10.1128/AAC.00114-20.

40. Lerat I., Cambau E., Roth Dit Bettoni R., Gaillard J., Jarlier V., Truffot C., Veziris N. In vivo evaluation of antibiotic activity against Mycobacterium abscessus // J. Infect. Dis. – Vol. 209. – N. 6. – P. 905-912. doi: 10.1093/infdis/jit614.

41. Li B., Ye M., Guo Q., Zhang Z., Yang S., Ma W. et al. Determination of MIC distribution and mechanisms of decreased susceptibility to bedaquiline among clinical isolates of Mycobacterium abscessus // Antimicrob. Agents Chemother. – 2018. – Vol. 62:e00175-18. doi: 10.1128/AAC.00175-18.

42. Litvinov V., Makarova M., Kudlay D., Nikolenko N., Mikhailova J. In vitro activity of bedaquiline against Mycobacterium avium complex // J. Med. Microbiol. – 2021. – Vol. 70. – N. 10. doi: 10.1099/jmm.0.001439.

43. Mirzayev F., Viney K., Linh N., Gonzalez-Angulo L., Gegia M., Jaramillo E., Zignol M., Kasaeva T. World Health Organization recommendations on the treatment of drug-resistant tuberculosis, 2020 update // Eur. Respir. J. – 2021. – Vol. 57. – N. 6:2003300. doi: 10.1183/13993003.03300-2020.

44. Mougari F, Guglielmetti L, Raskine L, Sermet-Gaudelus I, Veziris N, Cambau E. Infections caused by Mycobacterium abscessus: epidemiology, diagnostic tools and treatment // Expert. Rev. Anti Infect. Ther. – 2016. – N. 12. – P. 1139-1154. doi: 10.1080/14787210.2016.1238304.

45. Obregón-Henao A., Arnett K., Henao-Tamayo M., Massoudi L., Creissen E., Andries K. et al. Susceptibility of Mycobacterium abscessus to antimycobacterial drugs in preclinical models // Antimicrob. Agents Chemother. – 2015. – Vol. 59. – N. 11. – P. 6904-6912. doi: 10.1128/AAC.00459-15.

46. Pang Y., Zheng H., Tan Y., Song Y., Zhao Y. In vitro activity of bedaquiline against nontuberculous mycobacteria in China // Antimicrob. Agents Chemother. – 2017. – Vol. 61:e02627-16. doi: 10.1128/AAC.02627-16.

47. Pennington K., Vu A., Challener D., Rivera C., Shweta F. et al. Approach to the diagnosis and treatment of non-tuberculous mycobacterial disease // J. Clin. Tuberc. Other Mycobact. Dis. – 2021. –Vol. 24:100244. doi: 10.1016/j.jctube.2021.100244.

48. Philley J., DeGroote M., Honda J., Chan M., Kasperbauer S., Walter N., Chan E. Treatment of non-tuberculous mycobacterial lung disease // Curr. Treat. Options Infect. Dis. – 2016. N. 4. – P. 275-296. doi: 10.1007/s40506-016-0086-4.

49. Philley J., Griffith D. Medical management of pulmonary non-tuberculous mycobacterial disease // Thorac. Surg. Clin. – 2019. – Vol. 29. – N. 1. – P. 65-76. doi: 10.1016/j.thorsurg.2018.09.001.

50. Prevots D., Marras T. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria: a review // Clin. Chest Med. – 2015. – Vol. 36. – N. 1. – P. 13-34. doi: 10.1016/j.ccm.2014.10.002.

51. Raju R., Raju S., Zhao Y., Rubin E. Leveraging advances in tuberculosis diagnosis and treatment to address nontuberculous mycobacterial disease // Emerg. Infect. Dis. – 2016. – Vol. 22. – N. 3. – P. 365-369. doi: 10.3201/eid2203.151643.

52. Richards C., Olivier K. Nontuberculous mycobacteria in cystic fibrosis // Semin. Respir. Crit. Care Med. – 2019. – Vol. 40. – N. 6. – P. 737-750. doi: 10.1055/s-0039-1693706.

53. Ruth M., Sangen J., Remmers K., Pennings L., Svensson E., Aarnoutse R. et al. A bedaquiline/clofazimine combination regimen might add activity to the treatment of clinically relevant non-tuberculous mycobacteria // J. Antimicrob. Chemother. –2019. – Vol. 74. – N. 4. – P. 935-943. doi: 10.1093/jac/dky526

54. Sarathy J., Ganapathy U., Zimmerman M., Dartois V., Gengenbacher M., Dick T. TBAJ-876, a 3,5-dialkoxypyridine analogue of bedaquiline, is active against Mycobacterium abscessus // Antimicrob. Agents Chemother. – 2020. – Vol. 64:e02404-19. doi: 10.1128/AAC.02404-19.

55. Schulthess B., Akdoğan Kittana F., Hömke R., Sander P. In vitro bedaquiline and clofazimine susceptibility testing in Mycobacterium abscessus // Antimicrob. Agents Chemother. – 2022. – Vol. 66. – N. 5:e0234621. doi: 10.1128/aac.02346-21.

56. Sorayah R., Manimekalai M., Shin S., Koh W., Gruber G., Pethe K. Naturally-occurring polymorphisms in QcrB are responsible for resistance to telacebec in Mycobacterium abscessus // ACS Infect. Dis. – 2019. – Vol. 5:2055–2060. doi: 10.1021/acsinfecdis.9b00322.

57. To K., Cao R., Yegiazaryan A., Owens J., Venketaraman V. General overview of nontuberculous mycobacteria opportunistic pathogens: Mycobacterium avium and Mycobacterium abscessus // J. Clin. Med. – 2020. – Vol. 9. – N. 8:2541. doi: 10.3390/jcm9082541.

58. van Ingen J., Boeree M., van Soolingen D., Mouton J. Resistance mechanisms and drug susceptibility testing of nontuberculous mycobacteria // Drug Resist. Updat. – 2012. – Vol. 15. – N. 3. – P. 149-161. doi: 10.1016/j.drup.2012.04.001.

59. van Ingen J., Kuijper E. Drug susceptibility testing of nontuberculous mycobacteria // Future Microbiol. – 2014. – Vol. 9. – N. 9. – P. 1095-1110. doi: 10.2217/fmb.14.60.

60. Vesenbeckh S., Schönfeld N., Krieger D., Bettermann G., Bauer T., Rüssmann H. et al. Bedaquiline as a potential agent in the treatment of M. intracellulare and M. avium infections // Eur. Respir. J. – 2017(a). – Vol. 49. – N. 3: 1601969. doi: 10.1183/13993003.01969-2016.

61. Vesenbeckh S., Schönfeld N., Roth A., Bettermann G., Krieger D., Bauer T., Rüssmann H., Mauch H. Bedaquiline as a potential agent in the treatment of Mycobacterium abscessus infections // Eur. Respir. J. – 2017(b). – Vol. 49. – N. 5:1700083. doi: 10.1183/13993003.00083-2017.

62. Viljoen A., Raynaud C., Johansen M., Roquet-Banères F., Herrmann J., Daher W., Kremer L. Verapamil improves the activity of bedaquiline against Mycobacterium abscessus in vitro and in macrophages // Antimicrob. Agents Chemother. – 2019. – Vol. 63:e00705-19. doi: 10.1128/AAC.00705-19.

63. WHO. The use of bedaquiline in the treatment of multidrug-resistant tuberculosis: interim policy guidance. – Geneva: World Health Organization, 2013.

64. Yu X., Gao X., Li C., Luo J., Wen S., Zhang T. et al. In Vitro Activities of bedaquiline and delamanid against nontuberculous mycobacteria isolated in Beijing, China // Antimicrob. Agents Chemother. – 2019. – Vol. 63. – N. 8:e00031-19. doi: 10.1128/AAC.00031-19.