Чувствительность и специфичность методов генотипирования при диагностике туберкулеза с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя и микобактериозов
Аннотация
В обзоре литературы представлена роль тест-систем GenoType® при диагностике множественной (МЛУ) и широкой (ШЛУ) лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза (МБТ), а также микобактериозов. Многие исследования подтвердили высокую специфичность и чувствительность тест-системы GenoType® MTBDRplus для диагностики лекарственной устойчивости к изониазиду и рифампицину. С 2009 г. ВОЗ рекомендует данный метод для диагностики туберкулеза. Высокие показатели чувствительности и специфичности обнаружены в исследованиях методом GenoType® MTBDRsl при диагностике лекарственной устойчивости к офлоксацину. Тем не менее, ВОЗ из-за недостаточной чувствительности и специфичности к инъекционным препаратам и этамбутолу не рекомендует данный метод, как основной для диагностики ШЛУ МБТ. Использование методов GenoType® Mycobacterium CM/AS позволяют диагностировать нетуберкулезные микобактерии с высокой степенью чувствительности и специфичности. Методы GenoType® могут одновременно использоваться в противотуберкулезных учреждениях для диагностики туберкулеза с МЛУ/ШЛУ МБТ и микобактериозов.
Ключевые слова
туберкулез,
микобактериоз,
лекарственная устойчивость,
диагностика,
молекулярно-генетические методы.
Об авторах
А. О. Марьяндышев
ГБОУ ВПО «Северный государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия
Россия
Марьяндышев Андрей Олегович – заведующий кафедрой фтизиопульмонологии ГБОУ ВПО «Северный государственный медицинский университет» Минздрава России, доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАМН
163002, г. Архангельск, просп. Новгородский, д. 28.
Тел. 8-952-306-02-38
П. И. Елисеев
ГБУЗ Архангельской области «Архангельский клинический противотуберкулезный диспансер»
Россия
Россия
Елисеев Платон Иванович – врач-бактериолог ГБУЗ Архангельской области «Архангельский клинический противотуберкулезный диспансер»
163002, г. Архангельск, просп. Новгородский, д. 28.
Тел. 8-952-303-31-12
Список литературы
1. Елисеев П.И., Никишова Е.И., Горина Г.П., Марьяндышев А.О. Результаты применения методов GenoType MTBDRplus и BACTEC MGIT для определения лекарственной чувствительности возбудителя туберкулеза // Туберкулез и болезни легких. − 2012. – № 6. – С. 31-34.
2. Елисеев П.И., Тарасова И.В., Никишова Е.И., Марьяндышев А.О. Результаты применения метода GenoType MTBDRsl для определения лекарственной чувствительности возбудителя туберкулеза к этамбутолу, офлоксацину, канамицину и капреомицину в Архангельской области // Туберкулез и болезни легких. – 2013. – № 1. – С. 32-36.
3. Николаевский В.В., Балабанова Я.М., Миронова С.А. и др. Чувствительность и специфичность молекулярно-генетической тест-системы HAIN MTBDRplus для экспресс-диагностики лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза на материале мокроты // Туберкулез и болезни легких. – 2010. – № 4. – C. 28-34.
4. Макарова М.В. Нетуберкулезные микобактерии: Классификация, эпидемиология, патология у людей и животных, лабораторная диагностика (обзор литературы) // Туберкулез и болезни легких. – 2007. – № 10. – С. 7-17.
5. Туберкулез в Российской федерации 2010 г. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации. – М., 2011. – 280 с.
6. Anek-vorapong R., Sinthuwattanawibool C., Podewils L. et al. Validation of the GenoType® MTBDRplus assay for detection of MDR-TB in a public health laboratory in Thailand // BMC Inf. Dis. – 2010. – Vol. 10. – Article 123. – doi: 10.1186/1471-2334-10-1233.
7. Brossier F., Veziris N., Aubry F. et al. Detection by Genotype MTBDRsl test of complex mechanisms of resistance to second-line drugs and ethambutol in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis complex isolates // J. Clin. Microbiol. – 2010. – Vol. 48. – P. 1683-1689.
8. Bwanga F., Hoffner S., Haile M., Joloba M. Direct susceptibility testing for multidrug resistant tuberculosis: A meta-analysis // BMC Infect. Dis. – 2009. – Vol. 9. – Article 67. – doi:10.1186/1471-2334-9-67.
9. Cavusoglu C., Turhan A., Akinci P., Soyler I. Evaluation of the Genotype MTBDR assay for rapid detection of rifampin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – N. 7. – P. 2338-2342.
10. Campbell P., Morlock G., Sikes R. et al. Molecular detection of mutations associated with first- and second-line drug resistance compared with conventional drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis // Antimicrob. Agents Chemother. – 2011. –Vol. 55. – N. 5. – P. 2032-2041.
11. Chryssanthou E., Angeby K. The GenoType® MTBDRplus assay for detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Sweden // APMIS. – 2012. – Vol. 120. – N. 5 – P. 405-409.
12. Global tuberculosis report 2010. – World Health Organization, Geneva, 2010.
13. Guidelines for the programmatic management of drug-resistant tuberculosis. WHO 2011 update. – World Health Organization, Geneva, 2006.
14. Hillemann D., Rusch-Gerdes S., Richter E. Feasibility of the Genotype MTBDRsl assay for fluoroquinolone, amikacin-capreomycin, and ethambutol resistance testing of Mycobacterium tuberculosis strains and clinical specimens // J. Clin. Microbiol. – 2009. – Vol. 47. – N. 6 – P. 1767-1772.
15. Huang W., Chi T., Wu M., Jou R. Performance assessment of the GenoType MTBDRsl test and DNA sequencing for detection of second-line and ethambutol drug resistance among patients infected with multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 2011 – Vol. 49. – N. 7. – P. 2502-2508.
16. Huyen M., Tiemersma E., Lan N. Et al. Validation of the GenoType® MTBDRplus assay for diagnosis of multidrug resistant tuberculosis in South Vietnam // BMC Infect. Dis. – 2010. – Vol. 10. – Article 149. – doi: 10.1186/1471-2334-10-1499.
17. Ingen J., Simons S., Zwaan R. Comparative study on genotypic and phenotypic second-line drug resistance testing of Mycobacterium tuberculosis complex isolates // J. Clin. Microbiol. – 2010. – Vol. 48. – P. 2749-2753.
18. Instructions for use – Genotype MTBDRsl, Ver. 1.0. – Hain Lifescience, 2009.
19. Lee A.S., Jelfs P., Sintchenko V., Gilbert G. Identification of non-tuberculous mycobacteria: utility of the GenoType Mycobacterium CM/AS assay compared with HPLC and 16S rRNA genesequencing // J. Medical Microb. – 2009. – P. 900 –904.
20. Ling D.I., Zwerling A., Pai M. GenoType MTBDR assays for the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis: a meta-analysis // ERJ. – 2008. – Vol. 32. – N. 5. – P. 1165-1174.
21. Mironova S., Pimkina E., Kontsevaya I. Performance of the GenoType® MTBDRPlus assay in routine settings: a multicenter study // Eur. J. Clin. Microb. Infect. Dis. – 2012 – Vol. 31. – N. 7. – P. 1381-1387.
22. Nikolayevskyy V., Balabanova Y., Simak T. Performance of the Genotype® MTBDRPlus assay in the diagnosis of tuberculosis and drug resistance in Samara, Russian Federation // BMC Clin. Pathol. – 2009. – Vol. 9. – Article 2. – doi:10.1186/1472-6890-9-2.
23. O’Donnell N., Corcoran D., Lucey B., Barrett A. Molecular-based mycobacterial identification in a clinical laboratory setting: a comparison of two methods // Brit. J. Biomed. Science. – 2012. – Vol. 69. – N. 4. – P. 164-168.
24. Phillips L. TB’s revenge // Nature. – 2013 – Vol. 493. – N. 3. – P. 14-16.
25. Richter E., Rusch-Gerdes S., Hillemann D. Evaluation of the GenoType Mycobacterium assay for identification of Mycobacterial species from cultures // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – N. 5. – P. 1769-1775.
26. Said H., Kock M., Ismail N. et al. Evaluation of the GenoType® MTBDRsl assay for susceptibility testing of second-line anti-tuberculosis drugs // Int. J. Tub. Lung Dis. – 2012 – Vol. 16. − N. 1. – P. 104 – 109.
27. Safianowska A., Walkiewicz R., Nejman-Gryz P. The comparison between two methods for typing of nontuberculous mycobacteria: high pressure liquid chromatography and molecular assay Genotype Mycobacterium CM/AS // Pneumonol. Alergol. Polska. – 2010. – Vol. 78. − N. 5. – P. 363–368.
28. Somoskovi A., Dormandy J., Mitsani D. Use of smear-positive samples to assess the PCR-based Genotype MTBDR assay for rapid, direct detection of the Mycobacterium tuberculosis complex as well as its resistance to isoniazid and rifampin // J. Clin. Microb. – 2006. – Vol. 44. – N. 12. – P. 4459–4463.
29. WHO policy statement – the use of molecular line probe assay for the detection of resistance to second-line anti-tuberculosis drugs. – World Health Organization, Geneva., 2013.
Рецензия
Для цитирования:
Марьяндышев А.О., Елисеев П.И. Чувствительность и специфичность методов генотипирования при диагностике туберкулеза с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя и микобактериозов. Туберкулез и социально значимые заболевания. 2014;(1-2):64-70.
For citation:
Maryandyshev O.A., Eliseev P.I. SENSITIVITY AND SPECIFY OF GENOTYPING METHODS IN DIAGNOSIS OF MULTI- AND EXTENDED-DRUG RESISTANT TUBERCULOSIS AND NON-TUBERCULOSIS MYCOBACTERIAL DISEASES. Tuberculosis and socially significant diseases. 2014;(1-2):64-70. (In Russ.)
Просмотров:
21
Послать статью по эл. почте 