Detection of epidemiology significant genotype of Mycobacterium tuberculosis in clinical material
Abstract
This study presents genotyping and drug resistance mutations data of M. tuberculosis isolated from tuberculosis patients from 2012 to 2016 in Ural Research Institute of Phthisiopulmonology, Ekaterinburg. We performance capabilities of Amplitub-Beijing (Sintol, Russia), GenoType® MTBDR (Hain Lifescience, Germany) and TB-TEST (Biochip-IMB, Russia) test-systems for differentiation and diagnostic of epidemiology significant variants of M. tuberculosis (Beijing MDR) in clinical samples.
About the Authors
T. V. Umpeleva
ФГБУ «Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Минздрава России
Russian Federation
Russian Federation
L. A. Golubeva
ФГБУ «Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Минздрава России
Russian Federation
Russian Federation
L. S. Lavrenchuk
ФГБУ «Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Минздрава России
Russian Federation
Russian Federation
M. A. Kravchenko
ФГБУ «Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Минздрава России
Russian Federation
Russian Federation
N. I. Eremeeva
ФГБУ «Уральский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Минздрава России
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Вязовая А.А., Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Псковской области // Туберкулез и болезни легких. – 2012. – №. 6. – С. 35-39.
2. Дымова М.А. Альховик О.И., Чередниченко А.Г. и др. Идентификация генотипов Mycobacterium tuberculosis, ассоциированных с резистентностью и чувствительностью к лекарственным препаратам // Микробиология. – 2012. – Т. 13. – С. 672-681.
3. Маничева О.А., Нарвская О.В., Мокроусов И.В. и др. Лекарственная устойчивость, жизнеспособность и вирулентность in vitro штаммов Mycobacterium tuberculosis различных генотипов // Инфекция и иммунитет. – 2011. – Т. 1. – № 4. – С. 341-348.
4. Маркелов Ю.М., О.В. Нарвская Циркуляция штаммов возбудителя с множественной лекарственной устойчивостью на территории Республики Карелия // Туберкулез и болезни легких. – М., 2010. – № 2. – С. 54-57.
5. Мокроусов И.В., Нарвская О.В., Вязовая А.А. и др. Геноидентификация эпидемиологически и клинически значимого варианта M. tuberculosis Beijing B0/W148 // Туберкулез и болезни легких. – 2012. – № 10. – С. 33-36.
6. Нарвская О.В. Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его роль в эпидемическом процессе: дис. д-ра мед. наук. – СПб., 2003. – 173 с.
7. Николаевский В.В., Балабанова Я.М., Браун Т. и др. Молекулярное генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Центральном регионе России: эффективность сполиготипирования и MIRU-VNTR // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2005. – № 4. – С. 9-13.
8. Умпелева Т.В., Кравченко М.А., Еремеева Н.И. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Уральского региона России // Инфекция и иммунитет. – 2013. – Т. 3. – № 1. – С. 21-28.
9. Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза органов дыхания с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя. – М. – Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2014. – 72 с.
10. Drobniewski F., Balabanova Y., Ruddy M. et al. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family // Emerg. Infect. Dis. – 2002. – Vol. 8. – № 11. – P. 1320-1326.
11. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. – 1997. – № 35. – Р. 907-914.
12. Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 2006. – № 44. – Р. 4498-4510.
13. Surikova O. Voitech D., Kuzmicheva G. et al. Efficient differentiation of Mycobacterium tuberculosis strains of the W-Beijing family from Russia using highly polymorphic VNTR loci // Eur. J. Epidemiol. – 2005. – Vol. 20. – № 11. – P. 963-974.
14. Van Embden J.D., Cave M.D., Crawford J.T. et al. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology //J. Clin. Microbiol. – 1993. – № 31. – Р. 406-409.
Review
For citations:
Umpeleva T.V., Golubeva L.A., Lavrenchuk L.S., Kravchenko M.A., Eremeeva N.I. Detection of epidemiology significant genotype of Mycobacterium tuberculosis in clinical material. Tuberculosis and socially significant diseases. 2016;(2):19-23. (In Russ.)
Views:
22
Email this article 