POPULATION STRUCTURE OF MULTIDRUG RESISTANT MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS SPREADING IN MOSCOW
Abstract
The article presents the results of a retrospective study of multidrugresistant M. tuberculosis (MTB) strains obtained from patients with pulmonary tuberculosis who were under regular medical check-up in 2014 in Moscow. We determined of belonging of 274 MDR MTB strains to Beijing and non-Beijing lineages as well as determinants of drug resistance by spoligotyping and molecular DST for isoniazid, rifampicin, fluoroquinolones, aminoglycosides/polypeptides, and performed the comparative analysis of the genetic structure of the strains. 81% of the studied MTB were detected as highly transmissible, epidemiologically dangerous and difficult to treat Beijing strains with mutations, which, according to the literature, are associated with a high level of pathogen resistance to antitubercular drugs.
About the Authors
A. A. Khakhalina
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
M. A. Krasnova
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
E. M. Belilovsky
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
I. V. Peretokina
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
E. Yu. Nosova
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
S G. Safonova
ГБУЗ «Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Балабанова Я.М., Николаевский В.В., Радди М. и др. Преобладание штаммов Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing и факторы риска их трансмиссии в Самарской области // Проблемы туберкулеза и болезней легких. – 2006. – № 2. – С. 31-37.
2. Василенко Н.В., Будрицкий А.М. Современные взгляды на генетические семейства M. tuberculosis // Вестник ВГМУ. – 2014. – Т. 13. – № 5. – С. 16-22.
3. Воронкова О.В., Уразова О.И., Хасанова Р.Р. и др. Генетическая характеристика M. tuberculosis – возбудителей остропрогрессирующего деструктивного туберкулеза легких // Бюллетень сибирской медицины. – 2011. – № 1. – С. 12-18.
4. Мокроусов И.В., Вязова А.А., Старкова Д.А. и др. Высокоразрешающее типирование штаммов генотипа Beijing российской популяции Mycobacterium tuberculosis // Проблемы туберкулеза и болезней легких. – 2012. – № 7. – С. 46-53.
5. Противотуберкулезная работа в городе Москве. Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу за 2014 год / Под. ред. Е.М. Богородской и В.И. Литвинова. – М.: МНПЦБТ, 2015. – 168 с.
6. Противотуберкулезная работа в городе Москве. Аналитический обзор статистических показателей по туберкулезу за 2017 год / Под. ред. Е.М. Богородской, В.И. Литвинова, Е.М. Белиловского. – М.: МНПЦБТ, 2018. – 188 с.
7. Сапожникова Н.В., Скворцова Л.А., Павлова М.В. и др. Туберкулез легких, вызванный Mycobacterium tuberculosis различных генотипов // Проблемы туберкулеза и болезней легких. – 2003. – № 10. – С. 13-15.
8. Туберкулез в Российской Федерации, 2010 г. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации. – М., 2011. – 280 с.
9. Туберкулез в Российской Федерации, 2012/2013/2014 гг. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации и в мире. – М.,2015. – 312 с.
10. Умпелева Т.В., Кравченко М.А., Еремеева Н.И. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Уральского региона России // Инфекции и иммунитет. – 2013. – № 1 – С. 21-28.
11. Brossier F., Veziris N., Truffot-Pernot C. et al. Performance of the genotype MTBDR line probe assay for detection of resistance to rifampin and isoniazid in strains of Mycobacterium tuberculosis with low – and high-level resistance // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – N. 10. – P. 3659-64.
12. Brudey K., Driscoll J., Rigouts L. et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology // BMC Microbiol. – 2006. – N. 6:23. DOI:10.1186/1471-2180-6-23.
13. Canadian multicentre laboratory study for standardized second-line antimicrobial susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 2010. – N. 10. – P. 1128-1150.
14. Crudu V., Merker M., Lange C. et al. Nosocomial transmission of multidrug-resistant tuberculosis // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2015. – Vol. 19. – P. 1520-1523.
15. Crudu V., Romanceno E., Noroc E. et al. Beijing and H4/Ural genotypes of M.tuberculosis are predominatig among M&XDR patients in Moldova // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2014. – Vol. 18. – 157 p.
16. Du Q., Dai G., Long Q. et al. Mycobacterium tuberculosis rrs A1401G mutation correlates with high-level resistance to kanamycin, amikacin, and capreomycin in clinical isolates from mainland China // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. – 2013. – Vol. 77. – P. 138-142.
17. Dubiley S., Ignatova A., Mukhina T. et al. Molecular epidemiology of tuberculosis in the Tula area, Central Russia, before the introduction of the directly observed therapy strategy // Clin. Microbiol. Infect. – 2010. – Vol. 16. – P. 1421-1426.
18. Global tuberculosis report 2013. – Geneva: WHO, 2013. [Электронный ресурс]. URL: http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/index.hyml. (Дата обращения 01.04.2019).
19. Gori A., Bandera A., Marchetti G. et al. Spoligotyping and Mycobacterium tuberculosis // Emerg. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 11. – N. 8. – P. 1242-1248.
20. Huang W., Chi T., Wo M. et al. Performance assessment of the GenoType® MTBDRsl test and DNA sequencing for the detection of second-line and ethambutol drug resistance among patients with multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis // Clin. Microbiol. Infect. – 2011. – Vol. 49. – P. 2502-2508.
21. Ignatova A., Dubiley S., Stepanshina V. et al. Predominance of multi-drug-resistant LAM and Beijing family strains among Mycobacterium tuberculosis isolates recovered from prison inmates in Tula Region, Russia // Journal of Medical Microbiology. – 2006. – V.55. – P. 1413-1418.
22. Kovalev S.Y., Kamaev E.Y., Kravchenko M.A. et al. Genetic analysis of mycobacterium tuberculosis strains isolated in Ural region, Russian Federation, by MIRU-VNTR genotyping // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2005. – Vol. 9. – P. 746-752.
23. Mokrousov I. Molecular structure of Mycobacterium tuberculosis population in Russia and its interaction with neighboring countries // Int. J. Mycobacteriol. – 2015. – Vol. 4. – P. 56-57.
24. Mokrousov I. The quiet and controversial: Ural family of Mycobacterium tuberculosis // Infect. Genet. Evol. – 2012. – Vol. 12. – P. 619-629.
25. Mokrousov I., Vyazovaya A., Narvskaya O. Mycobacterium tuberculosis Latin American-Mediterranean family and its sublineages in the light of robust evolutionary marker // Journal of Bacteriology. – 2014. – Vol. 196. – N. 10. – P. 1833-1841.
26. Mokrousov I., Vyazovaya A., Otten T. et al. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region // PLoS One. – 2012. – Vol. 7: e41318.
27. Mokrousov I., Vyazovaya A., Solovieva N. et al. Trends in molecular epidemiology of drug-resistant tuberculosis in Republic of Karelia, Russian Federation // BMC Microbiol. – 2015. – Vol. 279. – N. 15. – P. 1-10.
28. Nosova E., Bukatina A., Isaeva Y. et al. Analysis of mutation in the gyrA and gyrB genes and their association with the resistance of Mycobacterium tuberculosis to levofloxacin, moxifloxacin and gatifloxacin // J. Med. Microbiol. – 2013. – Vol. 62. – P. 108-113.
29. Pang Y., Lu J., Wang Y. et al. Study of the rifampin monoresistance mechanism in Mycobacterium tuberculosis // Antimicrob. Agents Chemother. – 2013. – Vol. 57. – N. 2. – P. 893-900.
30. Ramazanzadeh R., Sayhemiri K. Prevalence of Beijing family in Mycobacterium tuberculosis in world population: Systematic review and meta-analysis // Int. J. Mycobacteriol. – 2014. – Vol. 3. – P. 41-45.
31. Reynaud Y., Millet J., Rastogi N. Genetic structuration, demography and evolutionary history of Mycobacterium tuberculosis LAM9 sublineage in the Americas as two distinct subpopulations revealed by bayesian analyses // PLoS One. – 2015. – Vol. 10. – P. 1-15.
32. Rusch-Gerdes S., Pfyffer G.E., Casal M. et al. Multicenter laboratory validation of the BACTEC MGIT 960 technique for testing susceptibilities of Mycobacterium tuberculosis to classical second-line drugs and newer antimicrobials // J. Clin. Microbiol. – 2006 –Vol. 44. – N. 3. – P. 688-692.
33. Sola С., Filliol I., Gutierrez M. et al. Spoligotype database of Mycobacterium tuberculosis: biogeographic distribution of shared types and epidemiologic and phylogenetic perspectives // Emerg. Infect. Dis. – 2001. – Vol. 7. – N. 3. – P. 390-396.
34. Vasconcellos S., Acosta C., Gomes L. et al. Strain classification of Mycobacterium tuberculosis isolates in Brazil based on genotypes obtained by spoligityping, mycobacterial interspersed repetitive unit typing and the presence of large sequence and single nucleotide polymorphism // PLoS One. – 2014. – Vol. 9: e107747.
35. Vyazovaya A, Mokrousov I, Solovieva N. et al. Tuberculous spondylitis in Russia and prominent role of multidrugresistant clone Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148 // Antimicrob Agents Chemother. – 2015. – Vol. 59. – P. 2349-57.
Review
For citations:
Khakhalina A.A., Krasnova M.A., Belilovsky E.M., Peretokina I.V., Nosova E.Yu., Safonova S.G. POPULATION STRUCTURE OF MULTIDRUG RESISTANT MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS SPREADING IN MOSCOW. Tuberculosis and socially significant diseases. 2019;(2):29-39. (In Russ.)
Views:
22
Email this article 